ADN et biodiversité
Des références ADN pour mieux identifier et suivre la biodiversité
L’identification des espèces est au cœur des sciences de la biodiversité et de l’environnement. Longtemps fondée sur la seule observation des caractères morphologiques, elle connaît aujourd’hui une véritable révolution grâce aux approches basées sur l’ADN. Ces méthodes permettent d’identifier les organismes à tous les stades de leur développement, même à partir de spécimens endommagés ou de fragments, ou encore d’associer larves et adultes d’une même espèce.
Une avancée majeure repose sur l’utilisation de l’ADN environnemental (ADNe) : des traces d’ADN laissées naturellement par les êtres vivants dans leur milieu. Cette technique innovante permet de détecter simultanément de nombreuses espèces à partir d’un simple échantillon, sans avoir à les capturer. Rapide, précise et prometteuse en termes de coûts, elle s’impose progressivement comme un outil clé du biomonitoring des écosystèmes.
La fiabilité de toutes les méthodes d’identification basées sur l’ADN repose sur un élément central : la qualité des bases de données de référence. Sans données validées et suffisamment complètes pour comparer les séquences obtenues, aucune identification fiable n’est possible. Or, les bases publiques internationales restent encore lacunaires et peu fiablespour de nombreux groupes.
Forte de son expertise taxonomique, l’équipe « insectes aquatiques » du Naturéum a lancé deux projets ambitieux : la création d’une base de référence ADN des éphémères d’Europe et d’une base dédiée aux éphémères, plécoptères et trichoptères (EPT) de Suisse. Sensibles aux perturbations, ces insectes sont d’excellents indicateurs de la qualité des milieux aquatiques. En collaboration avec des spécialistes nationaux et internationaux, plusieurs spécimens de chaque espèce ont été collectés et séquencés, à partir de collections existantes et de nouvelles campagnes de terrain, notamment liées à la mise à jour de la Liste rouge suisse.
Ces bases, couvrant plus de 800 espèces, seront mises à disposition des utilisateurs concernés afin de garantir des identifications fiables, et seront régulièrement enrichies au fil des nouvelles découvertes.
Responsables du projet : Jean-Luc Gattolliat et Laurent Vuataz
