Monitoring génétique de la faune suisse

ADN environnemental: de la détection des espèces à la génomique des populations

Les approches fondées sur l’ADN environnemental (ADNe) ont transformé le suivi de la biodiversité en permettant de détecter la présence d’espèces à partir d’échantillons prélevés dans l’eau, le sol ou l’air. La méthode de métabarcoding constitue l'approche la plus communément mise en œuvre. Elle repose sur l'analyse de courtes séquences génétiques, appelées barcodes, dans les échantillons d'ADNe, afin de détecter les espèces en présence. Cette approche aboutit à un inventaire rapide et non invasif des communautés biologiques.

Les scientifiques du Naturéum ont récemment franchi une étape supplémentaire en démontrant que l’ADNe pouvait aussi permettre d’identifier la diversité génétique à l’intérieur des espèces. En utilisant la grenouille rousse comme preuve de concept, cette approche ouvre la voie à une génomique des populations non invasive, ne nécessitant pas le prélèvement de tissus ou d’individus, ce qui est un avantage certain pour l’étude d’espèces menacées. 

Une étude pilote financée par le Fonds National Suisse et récemment finalisée a montré que des résultats convaincants pouvaient également être obtenus en utilisant l’ADNe de l’air pour évaluer la diversité génétique des populations d’un papillon quasi-menacé, l’Azuré des paluds.

Responsables de projet : Nadir Alvarez et Jérémy Gauthier